内地可以查到香港的开房记录吗

不可以

在公安内网上，是可以全国查询的。只要是使用自己的身份证进行登记住宿，那信息就会上传到公安内网数据库，需要时，可以查询。但是，此项数据属于个人隐私，只为侦破案件提供数据技术支持，私人事务原因是不给查询的。

16年小宾馆开的房记录能查到吗

可以。

开房的记录就有两方进行保存，一是警局，二是入住的宾馆，不过宾馆的住房信息保存期限为3个月~3年，少数高级一些的五星级酒店会保存3年以上。